Para apoyar la generación de conocimiento, el TEC cuenta con los diez centros de investigación. Centros de Investigación Centro de Investigación en Biotecnología (CIB) Escuela de Biología Centro de Investigación en Computación (CIC) Escuela de Ingeniería en Computación Centro de Investigación en Innovación Forestal (CIF) Escuela de Ingeniería Forestal Centro de Investigación en Protección Ambiental (CIPA) Escuela de Química Centro de Investigación y de Servicios Químicos y Microbiológicos (CEQIATEC) Escuela de Química Centro de Investigación y Desarrollo en Agricultura Sostenible para el Trópico Húmedo (CIDASTH) Escuela de Ingeniería en Agronomía Centro de Investigación y Extensión en Administración, Economía y Gestión Tecnológica (CIEADEG-TEC) Escuela de Administración de Empresas Centro de Investigación y Extensión en Ingeniería de los Materiales (CIEMTEC) Escuela de Ciencia e Ingeniería de los Materiales Centro de Investigación y Extensión en Tecnología e Ingeniería Agrícola (CETIA) Escuela de Ingeniería Agrícola Centro de Investigación y Gestión Agroindustrial (CIGA) Escuela de Agronegocios Centro de Investigaciones en Vivienda y Construcción (CIVCO) Escuela de Ingeniería en Construcción